Odnosi se na otpor struje koja teče kroz bateriju kada baterija radi. Sastoji se od omskog unutrašnjeg otpora i polarizacionog unutrašnjeg otpora.
Veliki unutrašnji otpor baterije će uzrokovati smanjenje radnog napona pražnjenja baterije i skraćenje vremena pražnjenja. Na unutrašnji otpor uglavnom utiču faktori kao što su materijal baterije, proizvodni proces i struktura baterije. To je važan parametar za mjerenje performansi baterije.
Napomena: Generalno, unutrašnji otpor u stanju punjenja se koristi kao standard. Unutrašnji otpor baterije treba mjeriti posebnim mjeračem unutrašnjeg otpora, a ne ohmskim zupčanikom multimetra.